NGS預(yù)處理，定位和從頭組裝

導(dǎo)入任何數(shù)據(jù)類型，解復(fù)用，修剪，過濾，匯編或映射到引用。

導(dǎo)入各種格式

原始數(shù)據(jù)機(jī)器直接關(guān)閉了？測(cè)序供應(yīng)商的組裝結(jié)果？來自生物信息學(xué)管道的分析輸出？Geneious擁有識(shí)別這一切的能力。只需拖放即可從包括Illumina，PacBio，Nanopore，Ion Torrent和454在內(nèi)的幾乎任何測(cè)序設(shè)備導(dǎo)入FASTQ，F(xiàn)ASTA，BAM，VCF，GFF和其他格式。

廣泛的預(yù)處理

清潔數(shù)據(jù)對(duì)準(zhǔn)確的下游分析至關(guān)重要。通過利用所有必要的預(yù)處理工具，確保您的數(shù)據(jù)處于最佳狀態(tài)：

通過條形碼解復(fù)用/分割
通過閱讀質(zhì)量修剪和過濾
修剪適配器
合并配對(duì)讀取
去重復(fù)
錯(cuò)誤正確并正常化
濾除嵌合體

可靠的參考映射

不要在質(zhì)量上妥協(xié)！與其他常用映射算法相比，獨(dú)特的Geneious Read映射器及其迭代方法可以產(chǎn)生出色的結(jié)果，并且可以正確對(duì)齊結(jié)構(gòu)變體。如果你需要一些不同的東西，Bowtie，TopHat和BBMap都可以在你的指尖中運(yùn)行。

靈活的 De Novo 序列拼接

Geneious Assembler具有足夠的靈活性，可處理來自任何類型測(cè)序儀的數(shù)據(jù)，并且可以讀取任意長(zhǎng)度的數(shù)據(jù)，包括來自不同測(cè)序儀的讀取和混合讀數(shù)。對(duì)于產(chǎn)生圓形重疊群的獨(dú)特能力的微生物組裝尤其有益。另外，運(yùn)行MIRA，SPAdes，Tadpole（蝌蚪）或Velvet也同樣容易，MAUVE基因組比對(duì)可以幫助您進(jìn)行基因組比對(duì)和整理。